La última orden cierra la trilogía de Thrawn, uno de los villanos más temidos del universo Star Wars.
La República asediada se tambalea tras los ataques del Gran Almirante Thrawn, que ha reunido los restos del ejercito imperial y ha repelido a los rebeldes con una tecnología abominable recuperada de la fortaleza secreta del Emperador: los soldados clon. Mientras Thrawn prepara su asedio final, Han y Chewbacca intentan formar una coalición de contrabandistas para lanzar un ataque desesperado contra el Imperio. Mientras tanto, Leia mantiene unida la Alianza y se prepara para el nacimiento de sus gemelos: dos nuevos Jedi. La República, abrumada por las naves y los clones liderados por Thrawn, tiene una última oportunidad… enviar un pequeño ejercito liderado por Luke Skywalker a la fortaleza que alberga las terribles máquinas de clonación de Thrawn.
Ahí les espera un peligro final: el Jedi oscuro C’baoth dirige la batalla final contra los rebeldes y reúne fuerzas para acabar lo que empezó: la destrucción de Luke Skywalker.